بازی Ganryu 2 داستان شخصیت موساشی را دنبال میکند که پس از پیروزی در برابر کجیرو، تصمیم گرفته است که اینبار دست خود را وارد هنر کرده و در شمال کشور ژاپن و در استان هوکایدو، به کار دیگری مشغول شود. در یکی از مدیتیشنهایی که او انجام میدهد، یک روح با وی تماس گرفته و پیامی به وی میدهد که مبارزه ما تمام نشده است و منتظر فرصت دیگری برای مبارزه مجدد هستیم. همین پیام سبب میشود که موساشی بار دیگر خودش را آماده کرده و در سراسر ژاپن به دنبال وی بگردد. روحهای عرفانی هم وارد عمل شده و به موساشی کمک میکنند که در این مسیر موفق عمل کند.