بازی Quake 4 نبردی ناامید کننده برای بقای زمین است و در برابر یک دشمن بیرحم، تنها باید بتوانید به یکی از آنها تبدیل شده و با نفوذ در بین آنها، موفق به شکستشان شوید. باید از سلاحها و ماشینهای پیشرفته استفاده کرده و گروهی از تفنگداران دریایی را نیز به تیم خود دعوت کنید. شما میتوانید نبرد را به سیاره اصلی آنها سوق داده و کره زمین را در امان نگه دارید. سیاره آنها استروگ نام دارد و تنها امید برای پیروزیتان، کشاندن نبرد به همین سیاره و نابود کردن آنها در خانه خودشان است.